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悲忏仪》（以上各一卷）等书。此外尚有石芝所编之《四明教行录》（七卷），为欲知四明之说者，所不可缺之书也。
有遵式者，与四明齐名，其德尚过之；号称慈云尊者，世人称之曰：“螺溪宝云振于前，四明慈云光其后，”其被推重如此。
遵式与四明交亲最厚，极推重四明，隐然助之；观其《所作指要钞序文》，可以知其故矣。（嗣法有二十五人）
四明派之势力。由前所示之系统，略可推知；南屏、广智、神照三家，法流最荣，就中以广智之末为第一。
四明一派之隆盛，不暇详述；仅略解系统图之大体于下，其它从省；欲知其详，须参考《佛祖统记》等书。
广智与后山外净觉相争，所著《广智遗编》、《阐幽志》其书现存；弟子继忠编《扶宗集》（五十卷），力明山家正统之说：其弟子草堂，于同门神智主张山外之说，标立异议时，造《义例随释》以抗之，其始末已述于前矣。息庵亦力辟异说，其下有圆辩者，门人众多。《佛祖统纪》曰：“先贤有云：四明中兴天台之道；圆辩中兴四明之宗；盖谓四明之后，有一派为知解之学，近似山外者；而圆辩者出，独能发挥祖意，以起四明；盛矣哉！或谓月堂得观行，止庵得宗旨，一庵雪堂得辩说，皆有师家之一体云。”月堂、止庵、一庵、雪堂、皆圆辩之弟子也。著《佛祖统记之志盘》，即出自此系统，以上所言，盖有暗斥他家之意。月堂著《圆宗解》；月堂门下有柏庭者，出《楞严玄览》、《金刚会解》、《圆觉略说》、《楞伽通义》、《因革论》、《附钞笺要》、《山家绪余集》、《三大部格言》、《简境十策》、《金鈚义解》、《宗教玄述》、《仁王疏记》等书；石芝宗晓编《四明教行录》；又著《乐邦文类》、《法华显应录》诸书；逸堂法登作圆顿宗眼。南屏之学问，至弟子会贤泰初之时，称为南屏家；可见其学风异于他处；慈云之弟子祖韶，评为“碎割法身讹误后学去也；”神照弟子楂庵，谓为“力勉勿传，有醍醐化糟粕，法藏变鬼火之语；”又广智对于《南屏类集》之批评曰：“类集之行，得失相半；得在其纲要，失在味其起尽；”由此可知南屏为类聚的学风，且受诸家种种批评者也；以上评语：载在《佛祖统记》故知志盘对之，亦多少有排斥之意也，南屏弟子从谏，传授天台教义于高丽义天僧统；此南屏家之下，清辩有《顶山记》，景德有《翻译名义集》，慈辩从谏之法流，自车溪经竹庵以至北峑；竹庵著《楞严集解》、《楞严补注》、《盂兰盆经补注》、《金刚通论》、《金刚事说》、《圆觉手鉴》、《竹庵草录》、《山家义苑》；宗印有《金刚新解》、《释弥勒偈》等书；此人在南屏家，号称高足；著《四教仪备释之古云》，著三大部者观之，此大势可以窥知矣。《会元续略》曰：“临济宗自宋季稍盛于江南，阅元而明，人宗大匠，所在都有；而韬光敛瑞，民莫得传；惟是天童、盘山、车溪三派鼎峙，支那学者，依为出世梯航；”要之：明未清初之际，禅宗已无昔日之盛，其系统可寻者，仅天童圆悟、盘山圆修、车溪性冲等三派而已。三人俱明末人，车溪寂于神宗万历三十九年（l611年）；天童寂于毅宗崇贞十四年（1641年）；盘山与天童同门，寂于崇祯八年（1635年）；其时代盖相同也。
圆悟，号密云；宜兴蒋氏子。耕樵为业；年三十，弃家事龙池传和尚。掩关千日；后过铜官山顶，忽觉情与无情，焕然顿现，觅纤毫过患不可得，遂大悟。凡六坐道场，法席最盛；临济之传，称为中兴。时天童古刹久废；悟慨然重兴之。所嘱付弟子十二人。悟有语录十二卷行世。
圆修，字天隐；荆溪闵氏子。依龙池剃染；参父母未生前本来面目；工候急切，至百余日；偶读楞严至佛叱阿难此非汝心处，默然有省。厥后掩关两载，终日蒲团；正在绝念忘境之际，忽闻驴鸣、豁然大悟。于万历庚申，结茅盘山。渐成大利。门下人材之众，与圆悟相埒。
同时有憨山大师德清，受禅于云谷法会；叹六祖大师旧址般废，再兴之。其著述颇多；化度至盛［入寂于熹宗天启三年（1623年）］兹举其著述之重要者于下：
《法华经通义》七卷
《法华经击节》一卷
《圆觉经直解》二卷
《大乘起信论疏略纂要》一卷
《大乘起信论直解》二卷
《观楞迦经记》十八卷
《金刚决疑》一卷
《般若心经直说》一卷
《肇论略注》二卷
《八十八祖真影传赞》五卷
《中庸直指》一卷
《老子道德经注》二卷
《庄子内篇注》四卷
又《憨山梦游集》（五十五卷），乃其门人据《憨山手记》而编辑者，此外尚有《憨山语录》（二十卷）。
明末高僧，有云栖袾宏；或以为属华严宗；然其一生所宏扬者，多属净土；盖宋明以后，各宗殆无不兼崇念佛也。曾至京师参遍融笑岩二师（天奇本瑞之法孙）。嗣至东昌，途闻鼓声，忽然大悟。因其居杭州云栖［入寂于明熹宗万历四十三年（1615年）］。故世称云栖大师云。其著述如下：
《楞严经摸象记》一卷
《阿弥陀经疏钞》四卷
《阿弥陀经疏钞事义》一卷
《阿弥陀经疏钞问辨）一卷
《四十八问答》一卷
《净土疑辨》一卷
《西方发愿文》一卷
《遗致经论疏节要》一卷
《禅关策进》二卷
《梵网菩萨戒疏发隐》七卷
《沙弥律仪要略》一卷
《往生集》三卷
《缁门崇行录》一卷
《直道录》一卷
《自知录》一卷
《山房杂录》二卷
《云栖遗稿》三卷
《竹窗随笔》三卷
《正讹集》一卷
此外尚有《云栖规约》、《僧训日记》、《戒杀放生文》、《放生仪》等小篇。盖云栖本出于禅，又盛弘念佛，与天台藕益，并称明末二大明星。闻谷大师广印，云栖弟子也；为作塔铭称之曰：“一度弟子，千有余人；得戒弟子，万有余人；”足证其化导之盛。
紫柏真可大师，亦当时英俊，尝至京师参遍融禅师：后游诸方，历参知识。念《大藏经》卷帙重多，外间不易得见；因改刻方册，俾易流通；命其弟子密藏、幻序，先后任刊刻之事；贮板于径山寂照庵；世所称径山藏是也。闻谷碑铭中，称闻谷慕紫柏事迹，兴寺于其旧址。憨山大师亦颇忻慕之。著有《般若心经说》（一卷）、《般若心经要论》（一卷）、《般若心经直谈》（一卷）、《紫柏老人集》（二十九卷）、《紫柏老人别集》（四卷）等书。其嗣法系统亦不明。
（五）诸宗融合之倾向
宋初佛教再兴，汴京中央诸寺，仅有法相宗、南山律宗；禅宗、天台宗，只盛行于江南；其北传也，为时颇后；前已述之。是知法相宗，自为天台宗荆溪大师论破以后，尚借玄奘余力，行于京都；已无学德兼备者，足传于后世；降及元代，历史所传者，惟镇江普照寺之普喜（吉祥禅师）、秦州景福寺之英辨（普觉）、及云岩之志德（佛光大师），称为元初学者而已；又明代有明昱者，唯识宗掉尾之大家也；著有《三十唯识约意》（一卷）、《百法明门论赘言）（一卷）、《观所缘缘论会释》（一卷）、《观所缘缘论释记）（一卷）、《唯识论俗诠》（十卷）、《因明人正理论直疏）（一卷）、《三支比量义钞》（一卷）等书；但自唐武宗会昌法难后，玄奘弟子窥基等所著之论疏，皆遭焚毁，中土失传；明昱殆未寓目；其传承既不详；所说亦多乖玄奘本旨；凡明代人之解释法相者，皆有此误，固不独明昱为然也。
明代禅、教、讲之区别，恐系宋末以来一般人之说；其教中似含有秘密佛教之仪式；故秘密佛教，在社会方面，颇占一部分势力；但在佛教史上，则无可记之事实。唐末宋初，秘密佛教人材间出，自后即不能窥知矣。
其仅可记者为讲求学问之华严宗；与实际佛教之念佛宗。但此二者，亦不能谓为纯粹之华严宗，或纯粹之念佛宗；盖此等宗教状态，或受天台之影响；或与禅宗混合而成也。
华严宗，宋初有长水子璇，即世所称长水大师是也。自澄观大师传圭峰；圭峰传彻微；彻微传海印；海印传法灯；法灯传长水；华严来至此，始复兴盛。相传长水初学华严于秀州洪敏，后闻琅玡慧觉（汾阳善昭之下）。之名，随之学禅。将嗣其法，琅玡谓之曰：“汝宗不振久矣；宜励志扶持，以报佛恩；”乃奉师训，居长水说华严，其徒多及千人。以贤首教义著《首楞严经义疏》（二十卷）、《大乘起信论疏笔削记》等书，知名于世。
长水之后有净源（其先出泉州晋水，故世称晋水净源）。学华严于五台山承迁（《宗脉记》则以为子璇亦承迁弟子，而以宗密而下，经传奥、从朗、现而至承迁，以承迁亦现之弟子，但承迁之传不详，承迁著有《注金狮子章》一卷，今存）。后亦受教于长水，最后居杭州之南山慧因寺。当是时，华严宗经典，多所散佚，适高丽之义天，来华学佛教，所携华严经典甚多；尝决疑于净源；因此华严宗之书，得复归于中国；义天还高丽后，以《华严经》一百八十卷赠净源；即六十、四十、八十等三译，即世称三大华严也；净源得此，为别建华严阁以藏之；故世亦谓慧因寺为高丽寺；称净源为华严宗之中兴者。著有《妄尽还源观疏钞补解》（一卷）、《原人论发微录》（三卷）；与师会之《一乘教义分齐章复古汜》（六卷）、《焚薪》（二卷）、希迪之《五教章集成记》（一卷）、道亭之《五教章义苑疏》（十卷），称宋四大家。元初有仲华文才（直觉国师）。《佛祖通载》渭其著有《意灯集》、《悬淡详略》、《肇论疏》等书。其弟子有大林了性（弘教大师）。幻堂宝严，京师之大宝积寺之妙文，亦为此宗之达者；明代有别峰大同，本学华严于春谷法师怀古肇公；后参中峰，中峰告之曰：“贤首之宗，日远而日微矣；子之器量，足以张大之；毋久淹乎此也；”遂专弘华严；弟子之嗣法者，分布列刹。著有《天柱稿》、《宝林类编》。同时有占庭善学，受华严于宝觉简公，融会甚深微妙之旨，学者宗之。降及明末，圆镜亦以学华严知名于世。云浪法师恩公，绍天界无极老人之统，承贤首二十三世之系、弘华严于金陵；三演大疏，七讲玄淡，尽得华严法界圆融无碍之旨；弟子分化四方者甚多。观元明之际，此宗学者，似尚不少；或者因其对于华严不能有所发挥，此宗遂渐就衰微乎？未可知也。
清凉宗密以后，华严颇近禅宗；长水既传琅玡之禅，别峰亦因中峰禅师之言，而弘华严；当时华严与禅之关系，略可推知。又自禅宗言之，法眼宗颇取华严教意，此可谓为取华严入禅者也。是则华严教义，纵存于元明之际，不过与禅相提携，以维持其余势耳（《宗脉记》以为自净源、冲观、师会、心、竹坡、悟、介、琼、南山、华春、谷遇，累代相承，而至别峰大同）。
念佛宗，宋初以后，流传颇广；但非独立一宗，凡抱天台、华严、乃至禅宗宗旨之人，以期念佛往生，或劝人念佛者；其人甚多，不遑枚举。天台宗之四明三派中，神照一家，颇劝念佛；神照慕古庐山之风，结白莲社而修念佛；其念佛修行之处，阅六七年而为大刹。仁宗时，赐以白莲寺寺号。神照之弟子曰：处咸，曰有严，曰处谦，《佛祖统纪》均有传；《处谦传》曰：“熙宁乙卯（八年）（1075年）四月丙寅，晨兴，沐浴更衣；集众讽普贤行法、阿弥陀经；乃曰：吾得无生日用久矣；今以无生而生净上，即入定寂然；”《有严传》曰：“畜一钵无长物，躬拾薪汲水，食惟三白；毗尼条章轻重等护二十年；专事净业；以安养为故乡；作怀净土诗八章，辞情凄切，人多乐诵；常时所修三昧，多获瑞应；”有严著有《阿弥陀礼文》。左伸，亦神照之弟子，刻西方三圣像，旦夜虔事；临终，请僧讽诵阿弥陀经未彻，即云：我已见佛光矣；遂沐浴更衣，戒左右勿哭，勿逼吾前，称佛结印而化。
处谦弟子曰净梵，曰择瑛，曰思照，曰行人宗利，俱念佛行者，其传载在《统纪》：《净梵传》载“十岁出家，常念阿弥陀佛。”《择瑛传》载有净土修证仪、阿弥陀佛身金色之偈；又辨西方此土二重观门之相，以劝专修净业者；殁时亦“西向讽弥陀经，卷终而逝。”《思照传》曰：“专修念佛三昧，筑小庵曰德云；后连小阁，为观落日之所；刻三圣像，每夜过半，即起念佛；月二十三日，率道俗击念终其身三十年；一旦语其徒曰：夜梦佛金身丈六，此往生之兆也；请僧七日以助念佛；屈指作印，奄从坐化。”《宗利传》亦云：“于静定中神游净土，见宝池莲花宝林境界；寻诣新城碧沼，专修念佛三昧，经历十年。”在处咸弟子元慧之下者，有了然；其传亦载“集众说法；复大书曰：因念佛力，得归极乐；凡在吾徒，宜当力学；归沐浴更衣，与众同诵阿弥陀经，至西方极乐世界而逝；”等语。以上所举，皆神照家也；其念佛修行之盛可知矣。
又念佛、天台二宗，关系最为密切；天台之行者，多修念佛，以期往生西方；故不能仅谓为神照家念佛；今不过示其特着之一家而已。此外天台诸家之念佛者，代有其人，不遑枚举；惟石芝宗晓（出于广智家之末，即着乐邦文类、乐邦遗稿者）。与净土教关系最深，故表而出之。
《释氏稽古略绩集》载元明之际，天台学者绝宗善继、瞽庵显示、无碍普智，皆专修净业，或弘扬之。《诸嗣宗脉记》载竹庵可观之法，传于北峰宗印；北峰之下，有相洲怀坦、剡源觉先、佛光法照等；自佛光经子庭师训出东溟慧日；其下有无碍普智；又自剡源，出云梦泽、佛鉴铦；二人门下各有著名之大师，即虎溪怀则、湛堂性澄是也。瞽庵、绝宗二人，共出湛堂之门。此外明初之蘧庵大枯，为玉冈蒙润之弟子；兼天台、华严之学；著有《弥陀略解》、《净土指归）等书，行于世。
宋以后，诸宗学者，兼力弘念佛之高僧，当以唐末之永明延寺、宋初之灵芝元照、明末之云栖袾宏、藕益智旭为最著。
永明延寺，法眼宗之大宗匠也；著《宗镜录》（见前法眼宗下）应吴越忠懿王之请，住灵隐；后迁永明；禅与念佛兼修，夜则往别峰，修行进念佛之法。忠懿王为之建西方香严殿焉。石芝宗晓，在古来净土行者中，选出最著者七人，为莲社之七祖，呼延寺为其第六祖。（第一祖庐山慧远；第二祖光明善导；第三祖般舟承远；第四祖五会法照；五祖新定少康；第六祖永明延寿；第七祖昭庆省常。）
灵芝元照律师，以天台教义释律；且当时禅宗盛，动逸纲纪；见持守坚固者，反嘲为执相，弊害甚大；遂唱导教、律、禅一致之论；同时以念佛之教，普劝道俗；其翻刻《慈愍三藏文集》也；宗旨有二：一为明慈愍之“教、律、禅”一致为其弘通念佛教之用（《慈愍集》今不存，故内容不明）。
“长卢宗颐，与当时名胜，盛结莲华净土念佛社；”乃《释氏稽古略》引苇江集中之语，盖在宋哲宗时代与元照同时也；所谓莲花念佛，其慕庐山白莲社之遗风乎。灵芝律师之前，当真宗之世，有圆净法师省常者，慕庐山之风，隐遁西湖之滨，结白莲社修念佛，后改净行社；当是时，入社者甚多；谓与昔时慧远之社媲美而无惭德［省常寂于真宗天禧四年（1020年）］。其后则有天台神照一如之念佛，慕庐山之风，建白莲寺，修念佛，已如前述。又元照之普劝念佛；同时有给事中冯楫，与贤士大夫，高僧逸士，思继庐山莲社遗风，月修系念净土会；又圆辨道琛法师，所至建每月二十三日之净土系念道场；与禅、律、讲诸宗学者道俗，同修念佛；不期而至者，常逾万人；宋代白莲社念佛之盛，可以知矣。
明有庐山遍融，后入汴京，盛弘其教；受上下流归向；云栖大师，曾参谒之；遍融告之曰：“不要贪名图利；勿扳缘贵要之门；惟一心办道，老实持戒念佛。”云栖虽亦参笑岩，迹其生平，似颇受遍融之感化。
云栖大师。于弘通念佛有甚深之因缘，于前举之著述，可以知之。云栖本禅宗之人，其教理之解释，则用华严宗，此盖受其师遍融之影响，《续稽古略》称遍融“证华严三昧，得大解脱法门；”可知其系华严宗人。故云栖判念佛教，谓其在小始终顿圆五教中，正属顿教，面兼通终圆二教也。
蕅益大师智旭，俗姓钟氏；少好儒，颇斥佛教；十七岁，读《云栖竹窗随笔》，大悔悟；二十四岁，梦受教于憨山，欣然慕之；以道远未能往学；乃依雪岭出家，雪岭，憨山弟子也。盖蕅益本出自禅宗，后拟注《梵网经》，作《四阄问佛》？一曰宗华严、二曰宗天台、三曰宗法相、四曰自立宗，频拈得天台；遂潜心研究天台著述，晚年住灵峰，世称灵峰老人。但蕅益于律、法相、念佛、种种方面，著述颇多；因近世天台学者，与禅宗华严法相，各持门户之见，不能和合；心勿谓然，故决不以一宗学者自居（寂于永历元年）。其著述现存者如下：
《楞严经玄义》二卷
《楞迦经玄义》二卷
《盂兰盆经新疏》一卷
《占察善恶业报经义疏》四卷《金刚般若经观心释》一卷
《法华经会义）十六卷
《佛遗教经解》一卷
《八大人觉经略解》一卷
《梵网经菩萨心地品合注》七卷
《楞严经文句》十卷
《楞迦经义疏》九卷
《占察善恶业报经玄义》二卷《金刚般若经破空论》一卷
《般若心经释要》一卷
《法华经纶贯》一卷
《四十二章经解》一卷
《阿弥陀经要解》一卷
《梵网戒本经笺要》一卷
《梵纲经菩萨心地品玄义》一卷
《四分律大小持戒犍度略释》一卷
《斋经科注》一卷
《优婆塞五戒相经笺要》一卷
《羯摩文释》一卷
《在家律要后集》三卷
《律要后集》一卷
《梵网经忏悔行法》一卷
《毗尼事义集要》十七卷
《沙弥十戒威仪录要》一卷
《大乘起信论裂网疏》六卷
《唯识心要》十卷
《三十唯识直解》一卷
《大乘百法明门论直解》一卷《观所缘缘论直解》一卷
《观所缘缘论释直解》一卷
《因明入正理论直解》一卷
《大乘止观法门释要》六卷
《八识规矩颂直解）一卷
《唐奘师真唯识量略解》一卷《六离合释法式略解》一卷
《教观网宗》一卷
《法华玄义节要》二卷
《占察善恶业报经忏仪》一卷《赞礼地藏菩萨忏仪》一卷
《大悲行法辩伪》一卷
《阅藏知津》四十八卷
《法海观澜》二卷
《绝余编》四卷
《见闻录》一卷
《辟邪集》一卷
《灵峰宗论》三十七卷
《选佛谱》二卷
《重订诸经日诵》二卷
《周易禅解》十卷
《四书解》卷数不详
蕅益之意以为佛教各宗，虽分派相争；然元来目的则一，不外乎明其自心而已。故唱诸宗融合一致论；渭佛教有教、禅、律三大区别：禅为佛心；教为佛语；律为佛行；此三者具备，始为完全教；执一以相争者，乃学者之误谬；此蕅益对于佛教思想之大体也。
总之宋以后之佛教，惟禅独盛；以无所羁束为高，其弊在放浪；因惹起其它教律之抗争，不易一致；故眼光高大者，或谓禅、教一致，或唱三学一源，以企其融合；其教中则以天台、华严、法相、念佛四者为主要也。此教、禅、律三者一致论之结局，而蕅益大师于是出世矣。蕅益之地位，于其著述之广，可以知之（元代虎溪怀则著《佛心印记》，对抗禅宗、华严宗，以天台为佛祖正传之心印，乃最有名之学者也）。
佛教内部既有融合论；而对于道、儒二教一致之论亦渐起；佛教徒注儒书及老、庄，以谋发挥其旨者亦渐多。但老子与佛教类似之处颇多，故其间争论亦烈；同时亦有相近之倾向。（始于南北朝时代，前既言之矣）。儒家与佛教之性质，相去较远；儒为世间法，可称政治学；佛为出世间法，属于宗教；范围不同，故其争较少。降及宋世，理学勃兴；形而上的宇宙论，近于佛老所谈；争端复烈，势所必然。盖宋儒之学问，大都受佛教影响；其后王阳明之良知说，亦决不能出佛教之范围；而与儒教以莫大影响者，自属当时最盛之禅宗。于是佛儒因性质类似而相争；未几，又产出融合论矣。
唐韩退之、宋欧阳修之毁佛也，概系攻击其表面上之事实（即附随于佛教而行之迷信，或其弊害）。而未能达佛教之教理，触其深远之问题。至柳宗元颇反对韩退之，而为佛教辩护；苏东坡则笃信佛教，于教理研究颇深。是则儒者中之儒佛一致论，唐时已有之矣。
佛教徒中，攻击儒教最有名者，莫如宋之契嵩。其《镡津文集》中，载有《非韩》三篇，取韩退之之文，一一驳诘，殆无余蕴。然就其辅教编观之，契嵩受儒教影响亦颇甚；其孝论，即以佛教而融合儒的世间教；此契嵩所以为儒教一致论者中之最古者也。当是时欧阳修、李泰伯，盛为排佛论；契嵩往晤泰伯，论儒释吻合，为之作《原教》、《孝论》。泰伯颇喜其文，异其说，致书欧阳修誉之。
其后明之愿证，著《观幻子》谓合儒释一贯之妙；沈士荣著《续原教论》，讨论三教异同；姚广孝出《道余录》，驳二程朱子之说；明太祖亦有《三教论》、《释道论》。此外禅僧中，有论道儒二教者；儒者中，亦多有论佛教者；今姑从略；惟就明末最后出之三教融合论者，憨山、蕅益二人述人：
憨山有《中庸直指》、《老子解》、《庄子内篇注》等书；蕅益有《四书解》、《周易禅解》等书；《憨山之老子解》，卷端有《观老庄影响论》（一名《三教源流同异论》）。其主张三教一致，最为明显；实欲以禅意使三教合一者也。其文曰：“余尝以三事自勖曰：不知春秋，不能涉世；不知老庄，不能忘世；不参禅，不能出世；知此，可与言学矣；”又曰：“孔子，人乘之圣也；故奉天以治人；老子，天乘之圣也；故清净无欲，离人而入天；声闻缘觉，超人天之圣也；故高超三界，远越四生，弃人天而不入；菩萨，超二乘之圣也；出人天而入人天，故往来三界，救度四生，出真而入俗；佛则超圣也；故能圣能凡，在天而天，在人而人，乃至异类分形，无往而不入；”由此观之：憨山三教一致之要领，可以知矣。